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vendredi 24 septembre 2021
Inscrits dans le deuxième Plan national pour la science ouverte annoncé par la ministre de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation le 6 juillet 2021, des prix récompenseront des initiatives emblématiques en matière de données de la recherche et de logiciel libre de la recherche :
Les prix seront remis début février 2022.
La ministre de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation a annoncé, le 6 juillet 2021, le 2e Plan national pour la science ouverte qui se déploiera jusqu'en 2024.
Ce plan vise à généraliser les pratiques de science ouverte en France, et à tripler le budget de la science ouverte pour le porter à 15 M€ par an.
Ce plan répond également à l'ambition de l'Union européenne de doter chaque pays d'un plan national pour la science ouverte.
Le 2e Plan national pour la science ouverte 2012-2024 définit des engagements renouvelés pour construire une science plus efficace, plus transparente et accessible pour les citoyens et les acteurs économiques et sociaux. Il comprend 4 axes majeurs :
Plus d'informations sur le site du Ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation, et sur le site Ouvrir la Science.
Les vraies truffes Tuber aestivum Vittad., T. borchii Vittad., T. magnatum Picco et T. melanosporum Vittad.
The true truffles, Tuber aestivum Vittad., T. borchii Vittad., T. magnatum Picco and T.
Cette plante généreuse pousse sur les berges de la Seine. A la fin de l’été, elle prend une belle teinte rouge vineuse.
Ses folioles fortement dentées ont de courts pétioles, contrairement à l’espèce Bidens tripartita, plus commune et indigène. Bidens frondosa est en effet une plante nord-américaine naturalisée, arrivée en France en 1920 (près de Paris). Elle s’est ensuite répandue dans la vallée de la Seine, de la Loire, en Bretagne et dans l’est de la France. En expansion, elle a tendance à supplanter Bidens tripartita.
Les fleurs sont discrètes, parfois dotées, en périphérie du capitule, de quelques ligules jaunes. Au second plan sur cette photo, on reconnait les larges feuilles d’un pied de guimauve.
Aux fleurs succèdent des akènes plats un peu verruqueux portant deux grandes épines munies de crochets qui lui permettent de se fixer, comme des harpons, sur les pelages et les pantalons des promeneurs.
Retrouvez une autre plante américaine naturalisée sur les berges de Seine :
Cyperus eragrostis
Bien qu’elle paraisse difficilement confondable avec une pâquerette, cette plante appartient bien à la famille des matricaires dont les autres représentantes présentées plutôt ont la même structure que la pâquerette : cœur de fleurs tubulées jaunes entouré de fleurs ligulées blanches. Chez la matricaire odorante l’évolution a fait disparaitre les ligules blanches, ne laissant que le cœur jaune.
Elle passe souvent inaperçue car elle affectionne le ras du sol, les sols tassés et piétinés comme les chemins que l’on oublie de regarder pourtant, elle a une caractéristique bien singulière : elle sent l’ananas !
Sources :
La flore d’Île-de-France par Philippe Jauzein et Olivier Nawrot
Le portrait de la matricaire odorante par Gilles
Retrouvez la série des « comme une pâquerette » :
La pâquerette
La marguerite
La matricaire inodore
La camomille
jeudi 23 septembre 2021
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Le Secrétariat du GBIF a publié un nouveau guide, Publier des données dérivées de l'ADN via des plateformes de données sur la biodiversité, qui fournit des informations pratiques aux détenteurs d'informations génomiques et métagénomiques, afin de mieux mettre en valeur les occurrences dérivées de l'ADN sur les plateformes de données sur la biodiversité telles que GBIF.org.
Une équipe d'experts d'Australie, d'Estonie, de Norvège, de Suède et du Danemark a décrit des principes et des pratiques à destination des détenteurs de données basées sur l'ADN souhaitant accroître leur réutilisabilité au-delà de leurs contextes « omiques » initiaux.
L'utilisation de données génétiques pour détecter, décrire, classer et quantifier les taxons s'est généralisée en écologie moléculaire, en phylogénétique et dans d'autres domaines de la recherche sur la biodiversité. Ce nouveau guide aide les détenteurs de ces données à voir les avantages de les rendre accessibles à un plus large éventail de recherches et de politiques sur la biodiversité.
En s'abstenant de décrire les détails spécifiques à chaque plateforme (et documentés ailleurs), en faveur de termes et de schémas plus communs, d'une description des pièges typiques et des meilleures pratiques, l'approche générale adoptée par les auteurs peut s'appliquer au partage de données dérivées de l'ADN via n'importe quelle plate-forme de données sur la biodiversité, y compris les nombreux systèmes nationaux utilisés dans le monde.
La publication du guide permettra également aux membres du réseau GBIF, notamment l'Ocean Biodiversity Information System (OBIS) et Atlas of Living Australia, d'aligner les efforts de leurs propres réseaux pour combiner les enregistrements détectés par l'ADN avec les données existantes issues des spécimens de musée, des observations sur le terrain et de la surveillance, des projets de science citoyenne et d'autres sources.
Le guide a été enrichi par des discussions avec des membres de plusieurs communautés différentes axées sur l'ADN, notamment le groupe de travail sur la biodiversité génomique du TDWG (Biodiversity Information Standards) et le groupe de travail TDWG sur l'interopérabilité durable Darwin Core-MIxS. L'expertise collective de ces communautés a aidé à clarifier la meilleure façon d'appliquer les termes des standards relatifs aux données génomiques, notamment MIxS, GGBN et MIQE. Ces ajouts sont pris en charge par une nouvelle extension du Darwin Core pour les données dérivées de l'ADN, actuellement en production à la fois dans l'outil GBIF Integrated Publishing Toolkit (IPT) et sur GBIF.org.
Le guide représente la prochaine étape des efforts du GBIF pour connecter son infrastructure de données et ses outils aux sources pertinentes d'informations génomiques et métagénomiques, en s'appuyant sur des collaborations avec la communauté UNITE, l'Institut européen de bioinformatique de l'EMBL (à travers ses archives européennes de nucléotides et sa plateforme MGnify), et l'International Barcode of Life Consortium (IBOL).
Plus d'informations sur le site du GBIF (en anglais)
Image : Collybie à pied velouté (Flammulina velutipes), Kursk, Fédération de Russie. Photo 2020 Oleg Ryzhkov via iNaturalist research-grade observations, sous licence CC BY-NC 4.0.
En français, il est parfois préférable de ne pas présenter de ' :' à la fin d'une chaîne d'un
ou d'undans un formulaire. Ce comportement dépend néanmoins de la langue et du contexte.Le filtre
|label_nettoyerélimine tout ' : ' et espace terminale éventuellement présents dans une chaîne de langue de SPIP ou de vos squelettes. Cela permet de les utiliser proprement comme étiquettes de formulaire.Exemple :
<:info_maximum|label_nettoyer:>Voir : le filtre |label_ponctuer qui, au contraire, inclue la ponctuation adaptée à la langue.
Coordonné par : Pascal NEIGE & Jean-Louis DOMMERGUES
Publié le 23 septembre 2021
Le stratotype du Sinémurien – un étage du Jurassique inférieur – est un lieu de référence géologique international situé dans la région de Semur-en-Auxois, jolie ville à dominante médiévale de Bourgogne-Franche-Comté. C’est Alcide d’Orbigny, l’un des naturalistes français les plus productifs et les plus féconds au cours de la première moitié du XIXe siècle, qui le définit en 1849 dans son Cours élémentaire de paléontologie et de géologie stratigraphiques. Il a alors largement bénéficié de l’aide de la très active Société des sciences de Semur et plus particulièrement de celle de plusieurs de ses membres... Suite
Préface de Patrick De Wever et Isabelle Rouget
En français, il est parfois préférable de ne pas présenter de ' :' à la fin d'une chaîne d'un
ou d'undans un formulaire. Ce comportement dépend néanmoins de la langue et du contexte.Le filtre
|label_ponctuerpermet d'ajouter si besoin un ' : ' terminal aux chaînes de texte utilisées comme étiquettes de formulaire.Il commence par mettre la première lettre de la chaîne en majuscule et par retirer de la fin de celle-ci le ' :' et l'éventuel espace précédent, au moyen du filtre |label_nettoyer, puis il ajoute la terminaison adaptée en tenant compte du contexte de langue.
Exemple :
<:info_maximum|label_ponctuer:>Il est possible
- de ne pas mettre la première lettre en majuscule en passant un argument vide au filtre :
<:info_maximum|label_ponctuer{''}:>- de modifier le caractère final et l'espace qui le précède éventuellement en modifiant la chaîne de langue 'label_ponctuer', localement dans votre fichier de langue (voir « Internationaliser les squelettes »).
Une nouvelle occurrence du genre Naja Laurenti, 1768 est signalée dans le Miocène supérieur de la localité de Solnechnodolsk en Russie. L’espèce est attribuée à N.
A new record of the genus Naja Laurenti, 1768 is described from the latest Miocene of Solnechnodolsk locality in Russia. It is assigned to N.