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vendredi 7 octobre 2022

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  • Christopher Schiller remporte le prix GBIF Jeunes Chercheurs 2022

    Le candidat au doctorat - et premier récipiendaire d'un prix d'Allemagne - est sélectionné pour avoir développé une approche automatisée d'apprentissage en profondeur permettant d'utiliser des photographies de scientifiques citoyens pour prédire les traits fonctionnels des plantes.

     

     

    Christopher Schiller, diplômé de l'Institut de technologie de Karlsruhe (KIT) et actuellement doctorant à la Freie Universität Berlin, a été nommé l'un des deux lauréats du Prix des jeunes chercheurs 2022.

    An jury d'experts a reconnu Schiller pour avoir développé une nouvelle démonstration du potentiel de combinaison des mégadonnées issues de la science professionnelle et citoyenne avec des modèles d'apprentissage automatique pour automatiser les évaluations à l'échelle mondiale de la diversité fonctionnelle des plantes. Nommé par la délégation allemande du GBIF , Schiller est le premier ressortissant allemand à recevoir le prix.

    Les traits fonctionnels des plantes sont essentiels pour comprendre et évaluer la biodiversité et les processus écosystémiques. Cependant, les exigences et la difficulté de les observer et de les mesurer directement limitent considérablement les données disponibles. Dans l'espoir de combler cette lacune, Schiller a proposé d'explorer le potentiel de l'application de la reconnaissance de formes basée sur l'apprentissage profond à des centaines de milliers de photographies prises par des scientifiques citoyens pour prédire et révéler l'expression de traits cachés à la vue.

    Schiller a commencé par utiliser des noms d'espèces pour lier des images et des coordonnées de plantes provenant d'observations de qualité iNaturalist Research via GBIF.org à des observations de traits d'experts de la base de données TRY sur les traits de plantes. Une fois ces connexions établies, les modèles de reconnaissance de formes pourraient commencer à apprendre les caractéristiques des plantes visibles (ou cachées) sur les photos pour générer des prédictions pour des traits tels que la surface foliaire, la hauteur de croissance, la masse des graines et la teneur en azote des feuilles.

    La prédiction de plusieurs traits clés basée uniquement sur les caractéristiques de l'image a produit des cartes de traits globaux qui reflètent les modèles macroécologiques mondiaux généraux à travers les formes de croissance et les biomes. L'introduction de modèles d'ensemble et de connaissances préalables sur la plasticité des traits et le climat a même amélioré les résultats.

     

    « À notre grande surprise, tout comme un écologiste qualifié pourrait probablement se rapprocher de ces traits en regardant des photographies de plantes et de leurs organes, les modèles initiaux ont produit des prédictions remarquablement précises », a déclaré Schiller. « Les résultats révèlent une autre manière dont les informations recueillies par les scientifiques citoyens peuvent étendre les sources de données volumineuses qui améliorent notre compréhension scientifique de la biodiversité. »

     

    « Les travaux de Christopher révèlent un autre domaine dans lequel les scientifiques citoyens peuvent contribuer à la recherche macroécologique et biogéographique », a déclaré Sebastian Schmidtlein, professeur et chef du groupe de recherche sur la végétation à l'Institut de géographie et de géoécologie, au KIT. « Je pense que cela offre une perspective prometteuse et un excellent exemple de ce que les données recueillies par GBIF et les nouvelles possibilités apportées par le Deep Learning peuvent faire pour la science. »

     

    « Christopher a poursuivi un programme de recherche exigeant qui traitait de données hétérogènes et multidimensionnelles, de relations écologiques complexes et de méthodes de pointe exigeantes en science des données », a déclaré Teja Kattenborn, chercheur au System Research du Centre de télédétection pour la Terre de l'Université de Leipzig qui a été directeur de thèse de Schiller alors qu'il était auparavant au KIT. « C'est un signe de sa réussite que cette étude révolutionnaire ait abouti à une publication évaluée par des pairs dans Nature Scientific Reports quelques mois seulement après la soumission de sa thèse. »

     

    Après avoir obtenu une maîtrise en géoécologie avec distinction du KIT, Schilling a maintenant commencé des recherches doctorales en télédétection et géoinformatique à l'Institut des sciences géographiques de la Freie Universität Berlin.

    Schiller partage le prix 2022 avec Armand Rausell-Moreno ode l'Universidad Internacional Menéndez Pelayo ien Espagne, les deux lauréats recevant un prix de 5 000 €.

     

    À propos du prix

    Depuis sa création en 2010, le prix annuel GBIF pour les jeunes chercheurs a cherché à promouvoir et à encourager l'innovation dans la recherche liée à la biodiversité en utilisant des données partagées via le réseau GBIF.

     

    À propos de l'Institut de technologie de Karlsruhe

    Le KIT crée et transmet des connaissances pour la société et l'environnement en tant que « université de recherche de l'association Helmholtz », où plus de 5 500 scientifiques coopèrent dans un large éventail de disciplines des sciences naturelles et de l'ingénierie, de l'économie, des sciences humaines et des sciences sociales.
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    À propos de la Freie Universität Berlin

    La Freie Universität Berlin est une institution de recherche de premier plan dont les 16 départements universitaires et instituts centraux entretiennent plus de 100 partenariats internationaux et proposent plus de 150 programmes diplômants dans un large éventail de matières.
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    Jury du Prix Jeunes Chercheurs 2022

     

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  • Armand Rausell-Moreno remporte le prix GBIF Jeunes Chercheurs 2022

     

    Le deuxième lauréat espagnol du prix consécutif vise à développer un processus de sélection reproductible et presque sans frais pour révéler la diversité potentielle cachée dans les concepts taxonomiques existants.

    Armand Rausell-Moreno, qui vient de terminer son Master en biodiversité des zones tropicales à l'Universidad Internacional Menéndez Pelayo (CSIC-UIMP), été nommé l'un des deux lauréats du Prix Jeunes Chercheurs 2022.

    Un jury d'experts a sélectionné Rausell-Moreno, qui a été nommé par la délégation espagnole du GBIF, pour ses recherches sur le développement d'un processus simple, reproductible et peu coûteux pour identifier les groupes et les populations dont les différences écologiques peuvent masquer la diversité cryptique qui se cache au sein des espèces actuellement décrites.

    Le programme d'études de Rausell-Moreno répond à un regain d'attention autour du concept de spéciation écologique. TCette forme bien documentée de divergence par sélection naturelle survient lorsque différentes populations d'organismes précédemment classées comme une seule espèce deviennent isolées sur le plan de la reproduction en raison de facteurs écologiques. La réduction ou l'élimination résultante du flux de gènes entre les deux populations, une fois détectée par l'analyse phylogénétique des relations évolutives présentes dans les échantillons d'ADN, peut entraîner une révision taxonomique qui divise une espèce en deux espèces (ou plus).

    L'approche logicielle proposée combine la modélisation de niche environnementale et les méthodologies de regroupement avec des phylogénies récemment publiées qui fournissent désormais des preuves de la présence de deux à cinq espèces différentes là où il n'y en avait qu'une auparavant. En utilisant des données sur d'autres variables environnementales parallèlement aux données d'occurrence du GBIF, Rausell-Moreno a testé l'approche sur des espèces telles que l'euphorbe baumière (Euphorbia balsamifera), le perce-oreille commun (Forficula auricularia) et le serpent royal de l'Est (Lampropeltis getula) pour analyser si le contexte écologique peut expliquer la structure des populations divergentes, en totalité ou en partie. La disponibilité de données ouvertes sur la biodiversité et d'outils existants à faible coût ou gratuits suggère la possibilité d'appliquer cette méthodologie de dépistage à une échelle beaucoup plus grande.

     

    « Sur la base des résultats obtenus jusqu'à présent, cette méthodologie est prometteuse en tant qu'outil de délimitation des populations d'espèces », a déclaré Rausell-Moreno. « Dans certains cas, nous avons pu classer correctement les individus dans leurs populations génétiquement déterminées avec une précision allant jusqu'à 92 % avant de fournir à l'algorithme toute information sur les affectations de clades à partir des études phylogénétiques. »

     

    « Armand est un étudiant dévoué et engagé dans une carrière dans le domaine de la biologie de la conservation et de la biodiversité" », a déclaré Javier Diequez Uribeondo, vice-directeur de la recherche au Real Jardín Botánico (RBJ-CSIC), 'un des 120 instituts de recherche compris dans le Conseil national espagnol de la recherche (CSIC: en espagnol, Consejo Superior de Investigaciones Científicas). « Sa passion pour la recherche est évidente à partir de ses excellents résultats, qui démontrent le potentiel de son approche de regroupement dans la conduite d'un criblage à grande échelle pour identifier les cas potentiels de spéciation écologique. »

     

    « Armand a clairement défini l'objectif de sa thèse après avoir réfléchi à tous les problèmes possibles auxquels il pourrait être confronté, ce qui a démontré son esprit d'analyse et quelque chose que je définirais comme une étincelle de chercheur peu commune chez les étudiants de maîtrise, », a déclaré Jesús Muñoz, chercheur au RBJ-CSIC et directeur de thèse de Rausell-Moreno. « L'étude ouvre de nouvelles voies de recherche pour accélérer la détection d'espèces cryptiques ou négligées, contribuant éventuellement à réduire l'effet de l'obstacle taxonomique auquel la plupart des groupes d'organismes sont confrontés. »

     

    Rausell-Moreno est le troisième étudiant espagnol à remporter le prix, après Nora Escribano et Julen Torrens Baile qui ont été sélectionnés en 2017 et 2021, respectivement. Rausell-Moreno vient de commencer à travailler comme technicien diplômé à l'Valencian Institute of Agrarian Research.

    Rausell-Moreno partage le prix 2022 avec Christopher Schiller de la Freie Universität Berlin en Allemagne, les deux lauréats recevant un prix de 5 000 €.

     

    À propos du prix

    Depuis sa création en 2010, le prix annuel GBIF pour les jeunes chercheurs a cherché à promouvoir et à encourager l'innovation dans la recherche liée à la biodiversité en utilisant des données partagées via le réseau GBIF.

     

    À propos de l'Universidad Internacional Menéndez Pelayo

    L'Universidad Internacional Menéndez Pelayo (CSIC-UIMP) est une institution indépendante affiliée au ministère des Universités dont le siège principal est à Madrid, dont la mission est de promouvoir la culture et la science, de favoriser les relations internationales et interrégionales, les échanges scientifiques et culturels, ainsi que ainsi que mener des activités de recherche avancées et spécialisées.
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    Jury du Prix Jeunes Chercheurs 2022

     

    Armand Rausell-Moreno, lauréat du GBIF Young Researchers Award 2022, lors d'un stage de master à Tenerife, îles Canaries, avril 2022.
    Photo publiée avec l'aimable autorisation de M. Rausell-Moreno.

     

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  • Relations homme-puma (Puma concolor (Linnaeus, 1771)) dans le Chaco sec de Córdoba, Argentine
    Human-puma (Puma concolor (Linnaeus, 1771)) relations in the Dry Chaco of Córdoba, Argentina

    Par le biais d’entretiens, d’observation de participants et d’une approche zooarchéologique, nous avons évalué les relations entre les paysans et le puma (Puma concolor (Linnaeus, 1771)) dans le Chaco argentin (Córdoba).

    Peasant and puma (Puma concolor (Linnaeus, 1771)) relations in the Argentinian Chaco (Córdoba) are assessed through interviews, participant observation and a zooarchaeological approach.


  • Six projets sélectionnés pour la surveillance de la biodiversité en Outre-mer
    "Six projets ont été sélectionnés suite à l’appel à manifestations d’intérêt « Développement de la surveillance de la biodiversité terrestre dans les Outre-mer » lancé par l’OFB."

  • Cyclophora annularia, l’Ephyre omicron
    Cyclophora annularis – Vouillé (79) © Gilles Carcassès

    Cyclophora annularia est un Geometridae commun, facile à observer d’avril à septembre quand il vient la nuit à la lumière. Ses chenilles, comme celles d’Acleris forsskaelana, vivent sur les érables.

    Je ne me lasse pas de le contempler : on dirait que ses ailes ont été décorées avec un pinceau très fin trempé dans une encre sépia. Bravo l’Artiste, quelle élégance dans la composition, quelle sûreté dans le trait !

    Ici, c’est un male, reconnaissable à ses antennes pectinées.

    Retrouvez d’autres Geometridae finement dessinés :

    L’Ennomos du lilas

    Pachycnemia hippocastanaria


jeudi 6 octobre 2022

mercredi 5 octobre 2022

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30 mai 2014 - Sur Facebook : Lac de Créteil - 94000 - Val de Marne -…

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